Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms