Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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