Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Topbp1Q6ZQF0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms