Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms