Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms