Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt9Q6RHW0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms