Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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