Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim37Q6PCX9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms