Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp49Q6P9L4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp49Q6P9L4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp49Q6P9L4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp49Q6P9L4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms