Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms