Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm4Q6IRU2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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