Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ParpbpQ6IRT3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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