Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms