Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nop58Q6DFW4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms