Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Sdc3Q64519 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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