Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms