Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc18Q640L5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms