Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms