Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms