Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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