Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms