Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms