Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CttnQ60598 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CttnQ60598 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CttnQ60598 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CttnQ60598 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CttnQ60598 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CttnQ60598 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms