Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Myh1Q5SX40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms