Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms