Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d4Q5RJF7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms