Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms