Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Fam208bQ5DTT3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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