Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2f8Q58FA4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms