Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eme2Q56A04 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eme2Q56A04 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms