Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CenpjQ569L8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CenpjQ569L8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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CenpjQ569L8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CenpjQ569L8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms