Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms