Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shank3Q4ACU6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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