Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc43Q3V0L5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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