Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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D130052B06RikQ3UW13 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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D130052B06RikQ3UW13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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