Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms