Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms