Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp3Q3ULW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms