Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms