Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx27Q3UHD6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx27Q3UHD6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx27Q3UHD6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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