Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nom1Q3UFM5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms