Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms