Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms