Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp6Q3U6U5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms