Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc174Q3U155 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms