Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctdnep1Q3TP92 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms