Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms