Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfaip8l3Q3TBL6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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