Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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