Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms